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核心計劃Ⅰ：生物多樣性的發現挑戰：了解地球上的生物多樣性現狀，以及生物多樣性如何變化，為什么變化。
重點：1. 評價當前的生物多樣性
2. 監測生物多樣性變化
3. 理解和預測生物多樣性的變化
核心計劃Ⅱ：生物多樣性的服務功能挑戰：理解生物多樣性與生態系統的功能和服務之間的關系
重點：1. 生物多樣性和生態系統功能(BEF)
2. 生態系統功能與提供的服務相聯系
3. 人類對生態系統服務變化的反應
核心計劃Ⅲ：生物多樣性的可持續利用挑戰：國際生物多樣性計劃中國委員會尋求生物多樣性的保護和可持續利用的科學方法
重點：1. 評估當前生物多樣性保護和可持續利用措施的成效
2. 社會、政治和經濟所導致的生物多樣性喪失
3. 通過社會選擇確定如何生物多樣性保護和可持續利用
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